台北市長當選人柯文哲說，
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，不放棄爭取北宜直線鐵路通過翡翠水庫的最短路線。環保團體表示，
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，柯文哲在環境工程方面缺乏「手術經驗」，
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，如此貿然發言令人失望。
柯文哲今天到宜蘭拜會縣長林聰賢，
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，兩人會後說，
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，不放棄爭取北宜直線鐵路最短路線，
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，但因最短路線可能涉及翡翠水庫環境影響評估問題，認為可由專業解決。
地球公民基金會台北辦公室主任蔡中岳受訪時說，原希望柯文哲治理市政能發揮急診醫生的「快、狠、準」，但柯文哲在環境工程方面缺乏「手術經驗」及「資料庫」，應先跟相關團體溝通，廣納各界意見，而不是還沒深入了解這項計畫就貿然發言，令人失望。
蔡中岳指出，翡翠水庫岩層中含有大量水脈，且現有技術仍無法精準探測，若進行大規模開發，風險極大，恐讓台北缺水狀況更嚴重。
台灣水資源保育聯盟發言人陳椒華說，水庫集水區為第一級環境敏感區，非必要的公共設施不能開發，認為柯文哲相關談話應該謹慎；她另質疑北宜直鐵興建必要性，認為台灣各地都需要建設，不應集中在北宜地區，特別是涉及水庫集水區，更不應該。
綠色陣線常務理事林長茂說，台北到宜蘭有很多道路可通，且翡翠水庫一帶有許多斷層通過，不適合再進行大規模開發，不應為了節省幾十分鐘車程，造成對環境永久傷害，是「非常不負責任的決定」。
林長茂說，柯文哲也許在醫學方面有成就，但不見得了解工程、生態保育，重大工程不應草率承諾，對一個講求科學的人來說「非常不科學」，呼籲他應對下一代負責。，