針對政府簽署自由貿易協定，
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，事前未與產業溝通，
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，也未公開協議內容，
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，經濟部次長卓士昭15日偕同行政院發言人鄭麗文召開記者會澄清，
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，即使是美國或是紐西蘭，
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，都是事前保密，
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，這絕對是國際的慣例。而對外界許多建議，
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，經濟部會擇優採納，
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，盡快做出洽簽自由貿易協定的標準作業流程。
卓士昭表示，
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，對所有國家來說，即使是美國，都是當作機密在處理。而以本月洽簽完成的台紐經濟合作協定，在去年5月份開始協商後，當時紐方就要求絕對保密。而紐西蘭在自己國家內，雖然會跟產業做諮商，但是也要求所有業者都必須簽訂保密協議，不能公開內容。
「這牽涉到國家利益。」卓士昭表示，兩岸服務貿易協議當初在談判時，雖然跟業者溝通，但業者過多，也不可能辦公聽會，無法全部進行徵詢；而立法院的內政和經濟委員會，則和每一位委員都做了溝通，甚至有3次會議報告，1次閉門會議。如果事先公開協議內容，等於是洩漏談判底牌，對於國家利益有害無益。
至於如何和業者溝通、協議內容能透露到什麼程度，是否跟國外一樣，強制要求業者簽署保密協議等，卓士昭說，未來還有很多自由貿易協定需要簽訂，未來會制訂洽簽自由貿易協定的標準作業流程，在不影響全體利益下，能夠和業者進行全面溝通。
針對馬總統指出，台灣簽署自由貿易協定已經嚴重落後他國。卓士昭指出，台灣目前和印度、印尼的洽談過程都非常順利，菲律賓部分已經在協議，但今年是否能夠完成，還不能確定。
自由貿易協定已經成為國際趨勢，經濟部也已完成洽簽自由貿易協定的路徑圖，行政院策略小組已核可，目前都正在跟各國積極研商中，相信未來能加速洽簽自由貿易協定的速度。
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