混油事件持續擴大，
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，衛生福利能力遭外界質疑。專家表示，
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，衛福部應該檢討目前稽查人力不足、中央與地方資訊嚴重落差等問題，
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，並成立跨部會的食安常設小組協調業務，
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，才能應付未來的食安事件。
食品藥物管理局前局長康照洲指出，
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，目前衛生稽查的人力、經費僅能應付廠商都是「好學生」時的狀況；要確切稽查「壞學生」，
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，無法僅靠後端的檢驗，
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，必須實地查廠才能發現問題。
台灣食品科學技術學會秘書長許輔表示，
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，稽查人員的專業不足是另一項挑戰。目前稽查人力僅一成五是食品專業，
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，且女性比率高；稽查需實地訪查工廠，女性稽查員較易面臨人身安全問題。
康照洲也說，稽查員需要經驗累積，但稽查員工作負擔重，流動率高，新手又容易因為經驗不足，而無法揪出業者違法事項。
另一個問題是，跨部會分工不清。康照洲說，國內食品受多個機關管轄，常連負責單位都不清楚自己管理的業務，例如米是農糧署管轄，但若加入黑豆成為雜糧，就納入衛福部負責。
許輔說，行政院下跨部會的食品安全會報，每半年召開一次會議，但此會報根本無實質作用；政府應成立一個層級夠高的食品常設小組，協調不同部會管轄的食品事件。
另外，中央主管機關與地方衛生單位有嚴重的資訊上落差，許輔說，食品藥物管理法在六月修法通過，但七、八月有醬油廠商向學會抱怨，自己的產品因標示問題在台北市被要求下架，新北市卻合格通過，不了解為何同一套法令，不同地方卻有不同標準？，